Die Mitglieder des Vorstands werden jeweils für 4 Jahre auf Vorschlag der Gemeindeleitung der FeG Bonn in Absprache mit dem amtierenden Vorstand von der Leitung des Bundes Freier evangelischer Gemeinden in Deutschland KdöR berufen.
Amtierende Vorstände sind:
- Reiner Dienlin, Bonn, Vorsitz
- Guido Sadler, Witten, Schatzmeister
- Marcus Wolf, Bonn, Schriftführer